공간전사체란?

○ 분자생물학과 공간정보를 결합하여, 실제 조직의 구조와 가깝게 입체적으로 유전자의 발현을 연구하는 기술임.

    조직 내에서 각 유전자가 발현되는 위치를 파악할 수 있고, 세포들이 주변 환경과 어떻게 상호작용하는지 알 수 있으며,

    그에 따라 유전자의 발현이 변화하는 양상을 이해할 수 있음.
 

○ 공간전사체 분석 기술은 그 목적에 따라 다양한 방식이 존재하며, 크게 시퀀싱 기반 공간전사체

    (Sequencing-based Spatial transcriptomics)와 imaging 기반 공간전사체 기술 (Imaging-based Spatial transcriptomics)이

    사용되고 있음.

왜 주목받고 있나?

○ 세포종들은 어떠한 기능을 담당하는지에 따라 나뉘게 됨. 전사체는 기능을 담당하는 최종산물인 단백질과 직접적으로

    연관되어 있기 때문에 전사체를 분석하여 특정 세포가 어떠한 세포종인가에 대한 정보를 얻을 수 있음.
 

○ 단일세포 전사체 분석 기술이 발달함에 따라 조직을 단일세포로 분리하여 전사체의 발현을 확인할 수 있게 되었음.

    조직 내에 어떤 종류의 세포가 존재하며 어떤 기능을 하는지 구별할 수 있었지만 실제 조직 내에서 세포 간의 상호작용을

    규명하는 것은 한계가 있었음

○ 공간전사체 분석은 전사체 기반 세포종 분류 이후 세포들이 특정 조직 내에서 공간적으로 어떠한 위치에 분포하는가에

    대한 정보를 줄 수 있고, 세포종들의 위치를 통해 어떤 세포들이 서로 상호작용하고 있는지 알 수 있음.

    암과 종양 미세환경(tumor microenvironment), 발생학(developmental biology), 혹은 뇌 관련 연구 분야에서

    세포 간의 상호작용은 매우 중요한 정보이기 때문에 공간 전사체 분석의 활용도가 높음.

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