1. 배경: 대사체학과 원시데이터 저장소

❍ 대사체학(metabolomics)은 생물의 대사(metabolism)에 의해 생성되는 모든 대사산물(metabolite)의 총체(totality)를 연구하는

    것을 목표하는 연구 방법론임
❍ 특히 국내에서 대사체학은 주로 임상 시료에 대한 연구를 통해 질병의 바이오마커를 발굴하는 연구 분야로 주로 알려져 있으나, 임

    상 연구 외에도 생물학의 다양한 분야에서 활용되고 있는 기술임
❍ 식물과 미생물에서 다양한 기능을 하는 이차대사산물(secondary metabolite, 보통 천연물natural products이라고 함)의 프로파

   일링이나, 식품 성분에 대한 정밀 분석, 환경 시료 내의 인체유래물 및 그 대사산물의 분석 등이 모두 대사체학이 활용되는 범주라고

   할 수 있음
❍ 모든 오믹스 계열 연구들이 그렇듯, 연구 결과의 재현성, 후속세대를 위한 효율적인 연구 등을 위해서 원시데이터의 공유가 매우 중

    요함. 현재 Nature Publishing Group 등 주요 학술지들이 대사체학 연구 논문에 대해 원시데이터 공유를 점차 의무화함에 따라

    대사체학 원시데이터 저장소의 이용율이 크게 증가하고 있음

2. 세계의 대사체학 원시데이터 저장소 현황

❍ 세계적으로 연구자들이 가장 많이 활용하는 대사체학 원시데이터 저장소로 MetaboLights, Metabolomics Workbench, GNPS-

    MassIVE의 세 곳을 들 수 있음
❍ MetaboLights는 유럽 분자생물학 연구소 산하 유럽 생물정보학 연구소(EMBL-EBI)가 2012년부터 운영하고 있음. 10여년 간

    MetaboLights를 이끌어 온 Claire O'Donovan 박사는 2024년 여름 은퇴하며, EMBL-EBI의 단백체 저장소인 PRIDE를 이끌어

    온 Juan Antonio Vizcaino박사가 그 후임이 될 것임. 특성상 유럽에서 이뤄지는 대사체학 연구 데이터의 상당수가 이 곳에 저장되

    고 있으며, 그 외의 국가에서 이뤄지는 대사체학 연구 데이터, 특히 인체 및 동물실험 유래물에 대한 대사체학 분석 데이터가 주로

    MetaboLights에 기탁되고 있음

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